Premier pôle européen de recherche, de soins et d’enseignement sur les maladies génétiques créé en 2007 au cœur du campus de l’Hôpital Necker-Enfants malades. Sa mission ? Mieux comprendre les maladies génétiques pour mieux les guérir.
L’Institut Imagine est un endroit unique au monde qui rassemble chercheurs, patients, médecins et personnels de santé dans une architecture créatrice de synergies au service d’une même ambition : changer la vie des familles touchées par les maladies génétiques.
Au sein de l’institut, la plateforme Data Science est particulièrement responsable du développement:
De bases de données pour les équipes de recherche : constitution de cohortes de patients et analyse des données ;
D’un entrepôt de données biomédicales : moteur de recherche et fouille de données ;
De méthodes de data mining et d’extractions d’information par des méthodes d’intelligence artificielle (Traitement automatique du langage, traitements des images)
D’applications pour aider les médecins et scientifiques dans leurs recherches
La plateforme est aussi impliquée dans des projets de recherche d’envergure nationale. Description détaillée de l’équipe : https://www.institutimagine.org/fr/nicolas-garcelon-757
Dans le cadre du projet Meditwin, la plateforme data science de l’Institut Imagine recrute un NLP/ML ENGINEER (H/F) pour participer à l’implémentation de pipelines de traitement de texte clinique. Le projet accompagne la transformation numérique des pratiques médicales à travers une plateforme européenne d’innovation, un écosystème d’utilisateurs et de partenaires fournisseurs de services pour l’aide à la décision médicale. Cette plateforme s'appuiera sur le développement de jumeaux numériques reproduisant fidèlement l’état de santé des patients et permettant de tester virtuellement différentes options thérapeutiques.
Dans le cadre de cette étude, la/le futur(e) NLP/ ML ENGINEER sera chargé(e) de
Participer au développement des pipelines d’extraction d’information depuis des comptes rendus cliniques
Mettre en place des procédures d’évaluation et de comparaison de modèles / pipelines candidats
Participer au contrôle qualité, à la création et mise en forme des données d’entrainement
Participer à l’industrialisation des pipelines développés
Communiquer les résultats obtenus (présentations, rapports, participation à la rédaction d’articles scientifiques)
Collaborer avec les équipes techniques, métiers et analytiques pour optimiser la gestion des données
COMPETENCES REQUISES
Connaissances
Bonne connaissance de python pour l’analyse de données
Bonne connaissance de librairies/outils de traitements de language naturel
Bonne connaissance de librairies/outils de deep learning
Bonne maîtrise des bases de données (PostgreSQL, Oracle, etc.).
Bonne connaissance de l’anglais technique
Capacité à travailler en mode projet avec des équipes pluridisciplinaires.
Connaissance de la recherche clinique et de l’environnement hospitalier serait un plus
Connaissance de l’outil RedCap serait un plus
Qualités
Rigueur, organisation et autonomie indispensables
Esprit d’équipe et écoute
Polyvalence
Capacité d’adaptation et curiosité
FORMATION
Formation Bac+5 ou plus (doctorat) en informatique, statistiques, data science ou domaine équivalent.
Profil junior ou plus expérimenté avec une première expérience dans un poste similaire
CONTRAT
CDD
Prise de fonction possible dès que possible
Localisation : Institut Imagine - 24 boulevard du Montparnasse 75015 PARIS
Télétravail possible 2j/semaine
Accès aux associations sportives et culturelles
Salaire selon profil et expérience.